粗面内质网的功能是合成蛋白质，并使其从细胞输送出去或在细胞内转运到其他部位。与分泌蛋白的运输有关，初步加工蛋白质（盘曲、折叠、糖基化）。凡蛋白质合成旺盛的细胞，粗面内质网便发达。在神经细胞中，粗面内质网的发达与记忆有关。滑面内质网的功能与糖类和脂类的合成、解毒、同化作用有关，还具有运输蛋白质的功能。